Pues, definitivamente nos la han dado con queso, esta es la respuesta exactamente como la he recibido:

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Estimada Cristina:

En relación a tu consulta sobre aceptar la forma de pago PayPal, te
confirmo que al tener una tienda eBay deberás aceptar PayPal como forma
de pago en todos tus anuncios, es por eso que las nuevas normas para
tiendas eBay exige tener una cuenta PayPal verificada y vinculada a tu
cuenta en eBay.

No será posible desmarcar la opción de pago con PayPal si tienes una
tienda eBay.

Si tienes alguna pregunta más no dudes en contactar con nosotros
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Asi que, aunque en las condiciones para tener tienda especifica que habia que tener una cuenta de Paypal vinculada a la cuenta ebay, lo que tenian bien escondido es que hay que ofrecer Paypal como metodo de pago en TODOS los articulos si tienes tienda.