Ebay solo puede marcar los pagos recibidos por Paypal. Cuando esos pagos se hacen efectivos, Paypal lo marca asi y envía ese estado a Ebay para actualizarlo. Con otros medios de pago no existe ese automatismo y se debe marcar de forma manual.

Cuando compras y le das a pagar, Ebay te enlaza a Paypal. Si tienes cuenta aparece listo para que hagas el pago, simplemente poniendo la contraseña. Si no tuvieses cuenta Paypal, te dan opcion a pagarlo como invitado haciendo el cargo directo en tu tarjeta... Que es lo que te ha podido pasar.

Asi que, puedes probar a darle al boton Pagar Ahora que debes tener en el mensaje que te envió Ebay tras la compra o esperar a que el vendedor te mande ese justificante que te permita de nuevo comenzar el proceso de pago si fuera posible.

De todas formas cuentanos como acaba la historia...

Saludos.