Yo hago lo siguiente:
Si me pagan por transferencia, simplemente tienen que enviar el importe acordado con el descuento.
Si lo hacen por paypal, en el instante en que recibo el pago, me voy a la página de paypal y justo donde aparece el pago de ese artículo, pinchas "emitir reembolso" y sigues los pasos.
Puedes reembolsar la cantidad que quieras, en este caso, 5 euros de tu descuento.
Saludos.
